[bdp]registry
Reproduzierbare Bioinformatik-Daten, für jedes Team. Versionieren Sie Referenzgenome, Annotationsdatenbanken und Datensätze wie Sie Code versionieren.
Holen Sie sich Ihren ersten Datensatz in 30 Sekunden
curl -sSfL https://bdp.dev/install.sh | sh# BDP installierenbdp init# Projekt initialisierenbdp source add uniprot:P01308-fasta@1.0# Datenquelle hinzufügenbdp pull# Herunterladen und zwischenspeichernDanach in Nextflow/Snakemake integrieren, Zitate & Datenverfügbarkeitserklärungen erstellen oder Post-Pull-Skripte zur Datenverarbeitung ausführen
Warum BDP?
Wie conda oder pip, aber für Ihre Datendateien — mit Reproduzierbarkeit, Provenienz und Zitierungen standardmäßig.
Vollständige Reproduzierbarkeit
Lock-Dateien für Daten, nicht nur Code. Fixieren Sie jedes Referenzgenom, jede Annotationsdatenbank und jeden Datensatz auf eine exakte Version.
Nahtlose Zusammenarbeit
Teilen Sie exakte Datenumgebungen teamübergreifend. Jeder arbeitet mit denselben Dateien — keine manuellen Downloads, kein Versionsdrift.
Intelligentes Ressourcenmanagement
Gemeinsamer Cache für Teammitglieder. Einmal herunterladen, überall nutzen. Bandbreite und Speicher sparen.
Automatisierte Zitierung
Erstellen Sie korrekte Zitate für jede Datenquelle. Verpassen Sie keine Referenz in Ihren Publikationen.
Integritätsprüfung
Automatische Prüfsummenvalidierung erkennt Manipulationen und Beschädigungen. Audit-Trails für Compliance.
Zentralisierte Entdeckung
Suchen Sie in Hunderten von Bioinformatik-Ressourcen an einem Ort. UniProt, NCBI, ChEBI, Ensembl und mehr.
Workflow-Integration
Native Unterstützung für Nextflow, Snakemake und CWL. Nahtlos in bestehende Pipelines integrieren.
So funktioniert es
Drei Befehle. Reproduzierbare Daten für immer.
Im Registry suchen
Datensätze nach Name, Organismus oder Kennung finden. Hunderte kuratierter Quellen — UniProt, NCBI, Ensembl, ChEBI und mehr — an einem Ort.
Zum Projekt hinzufügen
Die Quelle in bdp.yml deklarieren und committen. Jeder im Team — und jeder zukünftige Pipeline-Lauf — löst dieselbe Version auf.
Herunterladen und verifizieren
Lokal oder in einem gemeinsamen Team-Speicher zwischenspeichern. Prüfsummen werden automatisch verifiziert. Bereits gecachte Dateien werden übersprungen.
Für das Zeitalter der KI-Forschung entwickelt
BDP enthält einen vollständigen Model Context Protocol-Server. KI-Agenten können autonom Gen → Krankheit → Phänotyp → Signalweg → Medikament → Literatur traversieren.
24 MCP-Tools
Biomedizinischen Wissensgraphen suchen, abrufen und traversieren
Vollständiges Graph-Traversal
Gen → Krankheit → Phänotyp → Signalweg → Medikament → Literatur
MCP-kompatibel
Funktioniert mit Claude, jedem MCP-Client und benutzerdefinierten KI-Forschungsagenten
Für alle im Labor entwickelt
Egal ob Sie Pipelines schreiben, Artikel veröffentlichen oder KI-Forschungsagenten entwickeln.
Forscher
Datensätze auf exakte Versionen fixieren. Automatisch Zitate und Datenverfügbarkeitserklärungen für jede verwendete Quelle generieren.
Pipeline-Ingenieure
Native Integration mit Nextflow, Snakemake und CWL. bdp pull in jeden Workflow-Schritt einbinden — keine benutzerdefinierten Download-Skripte.
KI-Agenten
24 MCP-Tools für autonomes Daten-Traversal. KI-Agenten können Bioinformatik-Daten ohne menschliches Eingreifen suchen, abrufen und verarbeiten.
In 30 Sekunden starten
BDP installieren, eine Datenquelle hinzufügen und den ersten Datensatz herunterladen.